小智和皮卡丘等一行伙伴在旅途中前行。某日，寶可夢波爾凱尼恩從天而降并被迫與小智鎖在了一起。波爾凱尼恩與被人類傷害過的寶可夢們共同生活，因此非常討厭人類，但這條神奇的鎖鏈卻讓他們無法分開，奇妙的故事就此

講述互相敵視的兩個(gè)國家的公主與青年為了兩國未來扮演夫妻，并在相處過程中漸漸墜入愛河的故事。賀來賢人飾演優(yōu)秀建筑師納蘭巴雅，濱邊美波飾演溫柔的公主薩拉。

在電影開始開篇，場景好像被設(shè)置在一片大森林中。在森林內(nèi), 一聲強(qiáng)力的呼救被一個(gè)叫Yukinari的男孩聽到了。Yukinari是一個(gè)在殘酷社會中比較天真的男孩，但這次經(jīng)歷對他來說是可能使他終身受益。

為了成為合格的神奇寶貝訓(xùn)練師，小智（松本梨香 配音）、天桐（宮野真 配音）、艾莉絲（悠木碧 配音）帶著各自的小伙伴繼續(xù)在世界各地旅行。這次他們來到了美麗的山中小鎮(zhèn)艾茵多奧克參加神奇寶貝的比賽，在比賽的