只對(duì)女性有反應(yīng)、世界最強(qiáng)的超級(jí)兵器“Infinite Stratos”，通稱IS。因?yàn)镮S的問(wèn)世，性別平等被破壞，世界變成女尊男卑的社會(huì)。

主人公織斑一夏在高中的入學(xué)考試時(shí)誤入IS操縱者育成學(xué)?！癐S學(xué)園”的考試會(huì)場(chǎng)，并意外地啟動(dòng)了IS。成為全世界關(guān)注的“世界上唯一能操縱IS的男性”的一夏，被政府強(qiáng)制就讀向來(lái)只有女性的IS學(xué)園。

于是，織斑一夏從成為女校中的萬(wàn)紅叢中一點(diǎn)綠，從他青梅竹馬的劍道少女筱之之帚開(kāi)始，不同國(guó)籍不同性格的少女們圍繞著織斑一夏開(kāi)始了一場(chǎng)波瀾壯闊戀愛(ài)戰(zhàn)斗劇場(chǎng)。

突然侵襲的敵人，IS隱藏的秘密，以及織斑一夏和少女們的戀愛(ài)故事究竟將如何發(fā)展？